Pfaffenrot ist ein Ortsteil der Gemeinde Marxzell im Landkreis Karlsruhe.
Er wurde im Jahr 1255 erstmals urkundlich erwähnt, gemeinsam mit Burbach und Schielberg.
Über rund sechs Jahrhunderte gehörte Pfaffenrot zur Grundherrschaft des Klosters Frauenalb.
Ab 1803 war der Ort eine selbständige Gemeinde.
Am 1. Juli 1971 schloss sich Pfaffenrot mit weiteren Orten zur Gemeinde Marxzell zusammen.
Der Ort ist zudem mit der Familie des Automobilpioniers Carl Benz verbunden. Seine Vorfahren betrieben in Pfaffenrot eine Schmiede.
Mehrere Familienmitglieder hatten dort öffentliche Ämter inne, darunter ein Schultheiß ab 1735 und ein Bürgermeister ab 1821.